专业监理工程师发现工程设计不符合建筑工程质量标准，该监理工程师的正确做法是()。

选项B错误
下达设计整改通知单通常是设计单位或建设单位的职责，而非监理工程师的职责。

选项C错误
下达停工令是监理工程师在发现严重安全隐患或质量问题时采取的措施，但本题中仅提及工程设计不符合质量标准，并未提及安全隐患或严重质量问题。

选项D正确
专业监理工程师发现工程设计不符合建筑工程质量标准时，应报告建设单位要求设计院改正。这是监理工程师在工程质量管理中的重要职责之一。