工作流程图反映一个组织系统中各项工作之间的()关系。

选项B正确
工作流程图通过箭头和方框（或其他符号）来表示各项工作之间的先后顺序和逻辑关系。

选项C错误
主次关系更多地涉及工作的优先级或重要性排序，并非工作流程图的核心内容。

选项D错误
合同关系涉及合同双方的权利和义务，与工作流程图无直接关联。