关于工程合同价款约定及其内容的说法，正确的是()。

解析：
选项A错误
根据《建设工程施工合同（示范文本）》的规定，合同价款在合同中约定后，一般不得调整。除非合同另有约定或发生法律、法规变化以及工程项目变更等情况，才可以根据相关规定调整合同价款。因此，不能随意根据发包人的补充要求调整工程造价。

选项B正确
对安全文明施工费应约定支付计划、使用要求等，这是确保安全文明施工费用得到有效使用和监管的重要措施。

选项C错误
质量保证金的总额并不是固定为工程价款结算总额的5%，而是由发、承包双方在合同中约定。一般来说，质量保证金的比例不应超过工程价款结算总额的3%。

选项D错误
不实行招标的工程，其合同价款也不能简单地按承包人最低成本价签订。合同价款的确定应遵循公平、合理和诚实信用的原则，并应考虑工程成本、市场供求状况、合同双方的风险承担能力等因素。