建设工程施工组织总设计的编制依据有()。

选项B正确
合同文件明确了项目的具体要求和双方的权利义务，是施工组织总设计编制的重要依据。

选项C错误
施工企业资源配置情况虽然对施工组织总设计的编制有一定影响，但它并非编制的直接依据。

选项D正确
建设地区基础资料提供了项目所在地的自然环境、社会经济条件等信息，是施工组织总设计编制不可或缺的基础数据。

选项E错误
工程施工图纸及标准图虽然对施工组织设计有重要影响，但它们更多的是在施工组织设计的具体编制过程中作为参考，而非编制的直接依据。